食品與健康學院設食品科學與工程、食品質量與安全2個係，擁有包括“食品質量與安全北京實驗室”、“食品風味化學北京市重點實驗室”、“北京市食品添加劑工程技術研究中心”、“食品添加劑與配料北京高校工程研究中心”、“食品營養與人類健康北京高精尖創新中心”、“農產品質量安全追溯技術及應用國家工程實驗室（聯合）”、“中國-加拿大食品營養與健康聯合實驗室”在內的多個省市級實驗室/工程研究中心。學院實驗室總麵積2000餘平方米，擁有包括蛋白質晶體分析係統、高分辨飛行時間串聯質譜在內的多台新型分析設備，設備總額超過2.5億元。